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ありがとうございます

＞hey3さん
お役にたてたようで何よりです。
本文中でも書いていますが、番組途中のCMカットは音ズレや再生エラーを発生させる事が多々ありますので、十分注意して使って下さいね～(´∀｀)ノ

TSファイルのツールを探していてここにきました。使い方が説明されていて初心者にはとてもありがたいです。
このツールですが、使ってみたところうまく動きました。ただファイルの結合で、
v1.11.94では、ファイルサイズに、
1,048,576kbyteの制限があるようです。私の環境だけかもしれませんがご参考まで。

＞ M-)さん
お役に立てたようで何よりです。

編集＆結合後、再生だけなら問題ありませんが、別形式に変換する際は音ズレが発生しやすいので注意して下さいね(´∀｀)ノ

＞1,048,576kbyteの制限があるようです
約1GBあたりに制限が出ましたか・・・？
ウチでは発生しない現象です。
20GB位のTSファイルでも結合できてますよ。

解説ページの1枚目画像の(6)
Max File Sizeで制限がかかっていませんか？
「Clip」ボタンをOFFにしてみましょう。

「ここまでで注意」の下の図の状態で
各カットポイントに戻って緑色の部分をExcludeで赤くした後、
Includeで緑色に戻してみてください。
Processボタンで切り出し部分が分割されずに
ひとつのファイルになって出力されます。
こうすれば切った後の分割ファイルを
再び結合する手間と時間が節約できますよ。

＞Noriさん
編集で失敗多発したソースが手元に残っていない＆
数回しか試しませんでしたが、確かに失敗しないですね！
素晴らしい発見だと思います。

本文に裏技として追加紹介させて頂きました。
大変に有用な情報、感謝です(´∀｀)ノ

ありがとうございます。お役に立てて光栄です。
しかしながら本文に採用されるところまでを考えておらず、
単にわかりやすく説明するため、本当の意味を説明しませんでした。
申し訳ございません。

実は手順にExcludeの操作は必要なく、Includeだけで結合できます。

緑色の部分はそのままでIncludeを表すのではなく、
Includeボタンを押して初めてIncludeの意味になるようです。
このときたとえば黄色とかで色が変わればわかりやすいのですが、
同じ緑色に分割とIncludeの2つの意味を持たせているようです。
ちなみに赤はExcludeの１つの意味しかないようです。

加えて分割の場合、先頭位置から番号を振る設定になっているようですので、
先頭にExclude部分があると、連番先頭の0000ファイルがごみになってしまいます。
したがってこのときは少なくとも最初に出現する分割部分をIncludeにするのがよさそうです。

補足です。

CutとIncludeの設定は境界面になりますので、よく目を凝らしてみるとCutとIncludeで境界線が異なります。
Cutは上から下まで完全に結ばれているのに対してIncludeは上から半分までしか境界線がありません。

したがって

境界線が半分→前の緑部分と結合
境界線で遮断→前の緑部分と分割

と考えるのがよさそうです。

（前述のとおり、半分のときは色が黄色とかで変わってくれた方がわかり易いですよね）

＞Noriさん
更に詳しい解説ありがとうございます。
こちらでもその後色々と確認しています。

IncludeボタンとExcludeボタンだけを使って編集した場合の失敗が
、再現出来なくて困っています。。。（＾_＾;

失敗が多発していた頃(XP、athlon64x2)と現在(Win7 core i7)で環境が全然異なるので、環境によってはこのエラーは出ないのかもしれないです。

手持ちのバージョン(1.11.94)のHDTVtoMPEG2では、TSファイルの出力は上手く行かないようですね。(mpeg2ファイルでの出力は上手く作動するので問題ないけど)
これも環境によるのかな。。。

私の環境はWindowsXP 32bit（英語版）、
Core2Quad Q6600→3.2GHzにクロックアップという感じですが、
バージョン1.11.94で失敗はありませんし、
TSファイルの出力もうまくいってます。

ただ、HDDの空きが少なくなると（大体20GB以下）
TSファイルの読み込み時にエラーが出て
HDTVtoMPEG2で読み込めなくなります。

ファイルが破損云々のエラーのようだったと思いますが
原因は不明で、他のツールでは対象のファイルを普通に読めたりします。
動作環境にいろいろと制約があるのかもしれませんね。

TS録画・編集はHDD容量が足りなくなると不安定になるものが
結構ありますよね。私も気をつけるようにしています(´∀｀)ノ

私のIncludeボタンを使った編集でのエラーは
環境によるものだったのかも知れませんね。
これからはCut＆Excludeで様子見しながら編集してみます。